El manto debe conferir armonía a la forma del perro. Es muy denso, con el pelo de cobertura áspero al tacto y el subpelo suave y muy compacto. El pelo de la crin, el collar y la cola debe ser muy abundante. Las extremidades anteriores deben tener largos flecos. Las posteriores llevan bastante pelo por encima del jarrete, pero no debajo. Cuando el pelo del Collie es normal, es totalmente impermeable. El subpelo del Collie impide la penetración del agua hasta la piel. Dispone también de una sustancia especial que en poco tiempo escupe la suciedad y se mantiene limpio.

Los aficionados a los Collies tenemos la extraordinaria suerte de poder elegir entre una amplia gama de colores, aunque básicamente son tres: arena, tricolor y "blue merle". El color arena es conocido también como rubio, dorado, leonado o "color Lassie". Va desde el oro pálido hasta el caoba oscuro. En el tricolor (negro, blanco y dorado) predomina el color negro, con el pecho y el collar blanco y manchas fuego en las extremidades y en la cabeza. El "blue merle" es el más variopinto y difícil de describir. Es conocido con muchos nombres: azul mirlo, azul grisáceo, gris perla, negro marmóreo, azul plateado, etc. En general ha de predominar el tinte claro con pequeñas manchas fuego o oscuras.
Todos los mantos citados deben tener las típicas manchas blancas del Collie en proporciones más o menos importantes: collar blanco completo o parcial, pectoral blanco, piernas o pies blancos, punta de la cola blanca. Algunos ejemplares pueden tener una mancha blanca en el hocico y sobre el cráneo.

Su color varía desde el arena claro hasta un leonado oscuro, color caoba.
Los ejemplares arena pueden ser:

Arena claro ("golden"). No lleva el factor tricolor. El color dorado es dominante. En los cruces, todos los hijos serán arena, sea cual sea el color de su pareja.

Arena oscuro. Posee el gen tricolor junto con el gen dominante dorado. Generalmente son de color oscuro, leonados.

Es el color ancestral. Recesivo al dorado. Domina el negro, con marcas canelas en los costados del hocico, encima de los ojos e interior de las piernas, con el clásico color blanco en el collar, patas y punta de la cola.

Un gen dominante de dilución, en combinación con genes tricolor, produce Collies Blue Merle, comúnmente conocidos como AZULES. Es un color gris azulado con manchas negras, con las mismas marcas color canela del Tricolor.

No es aconsejable cruzar 2 azules. Los hijos pueden heredar el gen dominante de dilución de ambos padres. Así el color es reducido hasta casi el punto de desaparición por el gen en dúplex. Algunos hijos pueden nacer casi o totalmente blancos y sin defensas. El hocico y las patas carecen de pigmentación. El oído y la vista se ven severamente afectados. No efectuar este cruce sin estar seguros de los orígenes de los genes (criadores expertos).